Για την ανάλυση των δειγμάτων χρησιμοποιήθηκε το σύστημα IRMS (Isoprime100, συνδεδεμένο με το στοιχειακό αναλυτή “vario PYRO cube”) του εργαστηρίου Φυτικής Παραγωγής τμήματος Επιστήμης και Τεχνολογίας Τροφίμων του Παν. Πατρών. Ο συγκεκριμένος στοιχειακός αναλυτής λειτουργεί με σύστημα καύσης για ανάλυση Ν, C και S, παρέχοντας τη δυνατότητα προσδιορισμού ισοτοπικών δεδομένων και τα στοιχεία αυτά.

Το σύστημα καύσης αποτελείται από δύο αντιδραστήρες (για καύση και αναγωγή) και σύστημα δύο “purge and trap” στηλών (για το SO₂ και το CO₂). Για την αποφυγή επικάλυψης της κορυφής του Ν₂ από αυτή του CO στον IRMS, κατάλληλη στήλη προσροφά το CO, και αυτό ελευθερώνεται και οδηγείται για ανάλυση μετά την έκλουση του Ν₂.

Στα συλλεγέντα δείγματα πραγματοποιήθηκαν μετρήσεις αναλογίας σταθερών ισοτόπων με φασματομετρία μαζών (Isotope Ratio Mass Spectrometry-IRMS). Ειδικότερα σε κάθε ένα δείγμα προσδιορίστηκε η αναλογία σταθερών ισοτόπων ¹³C/¹²C, ¹⁵N/¹⁴N και ³⁴S/³²S.